Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G9

Cldn3, Claudin-3, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn3Q9Z0G9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms