Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVL1

Ap4s1, AP-4 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4s1Q9WVL1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms