Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Snx1Q9WV80 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms