Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUP4

Srd5a3, Polyprenol reductase, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srd5a3Q9WUP4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms