Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUL8

Cited4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited4Q9WUL8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cited4Q9WUL8 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms