Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK7

Opn3, Opsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3Q9WUK7 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
Opn3Q9WUK7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Opn3Q9WUK7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Opn3Q9WUK7 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Opn3Q9WUK7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Opn3Q9WUK7 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Opn3Q9WUK7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Opn3Q9WUK7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Opn3Q9WUK7 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Opn3Q9WUK7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Opn3Q9WUK7 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Opn3Q9WUK7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Opn3Q9WUK7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Opn3Q9WUK7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Opn3Q9WUK7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Opn3Q9WUK7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Opn3Q9WUK7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Opn3Q9WUK7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Opn3Q9WUK7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Opn3Q9WUK7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Opn3Q9WUK7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms