Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTK8

Spo11, Meiotic recombination protein SPO11, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spo11Q9WTK8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spo11Q9WTK8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spo11Q9WTK8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spo11Q9WTK8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spo11Q9WTK8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spo11Q9WTK8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spo11Q9WTK8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spo11Q9WTK8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spo11Q9WTK8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spo11Q9WTK8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spo11Q9WTK8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spo11Q9WTK8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Spo11Q9WTK8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spo11Q9WTK8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spo11Q9WTK8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spo11Q9WTK8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spo11Q9WTK8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spo11Q9WTK8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spo11Q9WTK8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spo11Q9WTK8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spo11Q9WTK8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spo11Q9WTK8 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spo11Q9WTK8 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spo11Q9WTK8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spo11Q9WTK8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spo11Q9WTK8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Spo11Q9WTK8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spo11Q9WTK8 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spo11Q9WTK8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spo11Q9WTK8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spo11Q9WTK8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spo11Q9WTK8 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spo11Q9WTK8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spo11Q9WTK8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spo11Q9WTK8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spo11Q9WTK8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spo11Q9WTK8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spo11Q9WTK8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spo11Q9WTK8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spo11Q9WTK8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spo11Q9WTK8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spo11Q9WTK8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spo11Q9WTK8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spo11Q9WTK8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spo11Q9WTK8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spo11Q9WTK8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spo11Q9WTK8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spo11Q9WTK8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Spo11Q9WTK8 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spo11Q9WTK8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spo11Q9WTK8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spo11Q9WTK8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spo11Q9WTK8 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spo11Q9WTK8 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spo11Q9WTK8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spo11Q9WTK8 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spo11Q9WTK8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spo11Q9WTK8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spo11Q9WTK8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spo11Q9WTK8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spo11Q9WTK8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spo11Q9WTK8 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spo11Q9WTK8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spo11Q9WTK8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spo11Q9WTK8 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spo11Q9WTK8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spo11Q9WTK8 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spo11Q9WTK8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spo11Q9WTK8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spo11Q9WTK8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spo11Q9WTK8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spo11Q9WTK8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spo11Q9WTK8 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spo11Q9WTK8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spo11Q9WTK8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spo11Q9WTK8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spo11Q9WTK8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spo11Q9WTK8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spo11Q9WTK8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spo11Q9WTK8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spo11Q9WTK8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spo11Q9WTK8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spo11Q9WTK8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spo11Q9WTK8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spo11Q9WTK8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spo11Q9WTK8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spo11Q9WTK8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spo11Q9WTK8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spo11Q9WTK8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spo11Q9WTK8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spo11Q9WTK8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spo11Q9WTK8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spo11Q9WTK8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spo11Q9WTK8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spo11Q9WTK8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Spo11Q9WTK8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spo11Q9WTK8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spo11Q9WTK8 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spo11Q9WTK8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spo11Q9WTK8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms