Protein–RNA interactions for Protein: Q9R269

Ppl, Periplakin, mousemouse

Predictions only

Length 1,755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PplQ9R269 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PplQ9R269 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PplQ9R269 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PplQ9R269 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PplQ9R269 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PplQ9R269 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PplQ9R269 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PplQ9R269 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PplQ9R269 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PplQ9R269 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PplQ9R269 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PplQ9R269 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PplQ9R269 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PplQ9R269 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PplQ9R269 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PplQ9R269 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PplQ9R269 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PplQ9R269 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PplQ9R269 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PplQ9R269 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PplQ9R269 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PplQ9R269 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PplQ9R269 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PplQ9R269 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PplQ9R269 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PplQ9R269 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PplQ9R269 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PplQ9R269 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PplQ9R269 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PplQ9R269 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PplQ9R269 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PplQ9R269 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PplQ9R269 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PplQ9R269 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PplQ9R269 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PplQ9R269 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PplQ9R269 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PplQ9R269 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PplQ9R269 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PplQ9R269 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PplQ9R269 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PplQ9R269 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PplQ9R269 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PplQ9R269 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PplQ9R269 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PplQ9R269 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PplQ9R269 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PplQ9R269 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PplQ9R269 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PplQ9R269 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PplQ9R269 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PplQ9R269 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PplQ9R269 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PplQ9R269 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PplQ9R269 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PplQ9R269 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PplQ9R269 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PplQ9R269 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PplQ9R269 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PplQ9R269 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PplQ9R269 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PplQ9R269 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PplQ9R269 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PplQ9R269 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PplQ9R269 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PplQ9R269 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PplQ9R269 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PplQ9R269 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PplQ9R269 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PplQ9R269 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PplQ9R269 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PplQ9R269 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PplQ9R269 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PplQ9R269 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PplQ9R269 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PplQ9R269 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PplQ9R269 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PplQ9R269 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PplQ9R269 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PplQ9R269 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PplQ9R269 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PplQ9R269 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PplQ9R269 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PplQ9R269 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PplQ9R269 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PplQ9R269 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PplQ9R269 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PplQ9R269 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PplQ9R269 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PplQ9R269 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PplQ9R269 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PplQ9R269 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PplQ9R269 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PplQ9R269 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PplQ9R269 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PplQ9R269 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PplQ9R269 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PplQ9R269 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PplQ9R269 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PplQ9R269 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms