Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TapbpQ9R233 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms