Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1W3

Rnf103, E3 ubiquitin-protein ligase RNF103, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf103Q9R1W3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf103Q9R1W3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf103Q9R1W3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf103Q9R1W3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf103Q9R1W3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf103Q9R1W3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf103Q9R1W3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf103Q9R1W3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf103Q9R1W3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf103Q9R1W3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf103Q9R1W3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rnf103Q9R1W3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rnf103Q9R1W3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rnf103Q9R1W3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rnf103Q9R1W3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf103Q9R1W3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf103Q9R1W3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf103Q9R1W3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf103Q9R1W3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf103Q9R1W3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf103Q9R1W3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf103Q9R1W3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf103Q9R1W3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf103Q9R1W3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf103Q9R1W3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf103Q9R1W3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf103Q9R1W3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf103Q9R1W3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf103Q9R1W3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf103Q9R1W3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf103Q9R1W3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf103Q9R1W3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf103Q9R1W3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf103Q9R1W3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf103Q9R1W3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf103Q9R1W3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf103Q9R1W3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf103Q9R1W3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf103Q9R1W3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf103Q9R1W3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf103Q9R1W3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf103Q9R1W3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf103Q9R1W3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf103Q9R1W3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf103Q9R1W3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf103Q9R1W3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf103Q9R1W3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf103Q9R1W3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf103Q9R1W3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf103Q9R1W3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf103Q9R1W3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf103Q9R1W3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf103Q9R1W3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf103Q9R1W3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf103Q9R1W3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf103Q9R1W3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf103Q9R1W3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf103Q9R1W3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf103Q9R1W3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf103Q9R1W3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf103Q9R1W3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf103Q9R1W3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf103Q9R1W3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf103Q9R1W3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf103Q9R1W3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf103Q9R1W3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf103Q9R1W3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf103Q9R1W3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf103Q9R1W3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf103Q9R1W3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf103Q9R1W3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf103Q9R1W3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf103Q9R1W3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf103Q9R1W3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf103Q9R1W3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf103Q9R1W3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf103Q9R1W3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf103Q9R1W3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf103Q9R1W3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf103Q9R1W3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf103Q9R1W3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf103Q9R1W3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf103Q9R1W3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf103Q9R1W3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf103Q9R1W3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf103Q9R1W3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf103Q9R1W3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf103Q9R1W3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf103Q9R1W3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf103Q9R1W3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf103Q9R1W3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf103Q9R1W3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf103Q9R1W3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf103Q9R1W3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf103Q9R1W3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf103Q9R1W3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf103Q9R1W3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf103Q9R1W3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf103Q9R1W3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf103Q9R1W3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms