Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Psma1Q9R1P4 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Psma1Q9R1P4 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Psma1Q9R1P4 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Psma1Q9R1P4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Psma1Q9R1P4 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Psma1Q9R1P4 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Psma1Q9R1P4 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Psma1Q9R1P4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Psma1Q9R1P4 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Psma1Q9R1P4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Psma1Q9R1P4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Psma1Q9R1P4 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Psma1Q9R1P4 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Psma1Q9R1P4 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Psma1Q9R1P4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Psma1Q9R1P4 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Psma1Q9R1P4 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Psma1Q9R1P4 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Psma1Q9R1P4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Psma1Q9R1P4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Psma1Q9R1P4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Psma1Q9R1P4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Psma1Q9R1P4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Psma1Q9R1P4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Psma1Q9R1P4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Psma1Q9R1P4 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Psma1Q9R1P4 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Psma1Q9R1P4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Psma1Q9R1P4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Psma1Q9R1P4 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Psma1Q9R1P4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Psma1Q9R1P4 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Psma1Q9R1P4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Psma1Q9R1P4 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Psma1Q9R1P4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Psma1Q9R1P4 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Psma1Q9R1P4 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Psma1Q9R1P4 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Psma1Q9R1P4 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Psma1Q9R1P4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Psma1Q9R1P4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Psma1Q9R1P4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Psma1Q9R1P4 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Psma1Q9R1P4 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Psma1Q9R1P4 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Psma1Q9R1P4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Psma1Q9R1P4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Psma1Q9R1P4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Psma1Q9R1P4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Psma1Q9R1P4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Psma1Q9R1P4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Psma1Q9R1P4 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Psma1Q9R1P4 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Psma1Q9R1P4 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Psma1Q9R1P4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Psma1Q9R1P4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Psma1Q9R1P4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Psma1Q9R1P4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Psma1Q9R1P4 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Psma1Q9R1P4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Psma1Q9R1P4 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Psma1Q9R1P4 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Psma1Q9R1P4 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Psma1Q9R1P4 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Psma1Q9R1P4 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Psma1Q9R1P4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Psma1Q9R1P4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Psma1Q9R1P4 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Psma1Q9R1P4 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Psma1Q9R1P4 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Psma1Q9R1P4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Psma1Q9R1P4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Psma1Q9R1P4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Psma1Q9R1P4 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Psma1Q9R1P4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Psma1Q9R1P4 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Psma1Q9R1P4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Psma1Q9R1P4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Psma1Q9R1P4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Psma1Q9R1P4 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Psma1Q9R1P4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Psma1Q9R1P4 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Psma1Q9R1P4 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Psma1Q9R1P4 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Psma1Q9R1P4 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Psma1Q9R1P4 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Psma1Q9R1P4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Psma1Q9R1P4 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Psma1Q9R1P4 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Psma1Q9R1P4 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Psma1Q9R1P4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Psma1Q9R1P4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Psma1Q9R1P4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Psma1Q9R1P4 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Psma1Q9R1P4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Psma1Q9R1P4 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Psma1Q9R1P4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Psma1Q9R1P4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Psma1Q9R1P4 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms