Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B9

Plod2, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod2Q9R0B9 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms