Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms