Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ88

Vps29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps29Q9QZ88 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms