Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn8Q9QZ49 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms