Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms