Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms