Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK2

Rad18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad18Q9QXK2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms