Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA5

Lsm4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm4Q9QXA5 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lsm4Q9QXA5 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lsm4Q9QXA5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lsm4Q9QXA5 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lsm4Q9QXA5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lsm4Q9QXA5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lsm4Q9QXA5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lsm4Q9QXA5 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lsm4Q9QXA5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Lsm4Q9QXA5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lsm4Q9QXA5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lsm4Q9QXA5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lsm4Q9QXA5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lsm4Q9QXA5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lsm4Q9QXA5 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lsm4Q9QXA5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lsm4Q9QXA5 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lsm4Q9QXA5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lsm4Q9QXA5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lsm4Q9QXA5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lsm4Q9QXA5 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lsm4Q9QXA5 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lsm4Q9QXA5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lsm4Q9QXA5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lsm4Q9QXA5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lsm4Q9QXA5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lsm4Q9QXA5 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lsm4Q9QXA5 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lsm4Q9QXA5 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lsm4Q9QXA5 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lsm4Q9QXA5 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lsm4Q9QXA5 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lsm4Q9QXA5 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lsm4Q9QXA5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lsm4Q9QXA5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lsm4Q9QXA5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lsm4Q9QXA5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Lsm4Q9QXA5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lsm4Q9QXA5 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lsm4Q9QXA5 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lsm4Q9QXA5 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lsm4Q9QXA5 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lsm4Q9QXA5 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lsm4Q9QXA5 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Lsm4Q9QXA5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lsm4Q9QXA5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lsm4Q9QXA5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lsm4Q9QXA5 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lsm4Q9QXA5 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lsm4Q9QXA5 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lsm4Q9QXA5 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lsm4Q9QXA5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lsm4Q9QXA5 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Lsm4Q9QXA5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lsm4Q9QXA5 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lsm4Q9QXA5 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lsm4Q9QXA5 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lsm4Q9QXA5 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lsm4Q9QXA5 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lsm4Q9QXA5 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lsm4Q9QXA5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lsm4Q9QXA5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Lsm4Q9QXA5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Lsm4Q9QXA5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lsm4Q9QXA5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Lsm4Q9QXA5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lsm4Q9QXA5 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lsm4Q9QXA5 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lsm4Q9QXA5 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lsm4Q9QXA5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lsm4Q9QXA5 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lsm4Q9QXA5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lsm4Q9QXA5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lsm4Q9QXA5 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lsm4Q9QXA5 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lsm4Q9QXA5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lsm4Q9QXA5 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lsm4Q9QXA5 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lsm4Q9QXA5 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lsm4Q9QXA5 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lsm4Q9QXA5 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Lsm4Q9QXA5 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lsm4Q9QXA5 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lsm4Q9QXA5 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lsm4Q9QXA5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lsm4Q9QXA5 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lsm4Q9QXA5 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lsm4Q9QXA5 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lsm4Q9QXA5 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lsm4Q9QXA5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lsm4Q9QXA5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lsm4Q9QXA5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lsm4Q9QXA5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lsm4Q9QXA5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lsm4Q9QXA5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lsm4Q9QXA5 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lsm4Q9QXA5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lsm4Q9QXA5 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lsm4Q9QXA5 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lsm4Q9QXA5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms