Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trpc5Q9QX29 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trpc5Q9QX29 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trpc5Q9QX29 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trpc5Q9QX29 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trpc5Q9QX29 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
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Trpc5Q9QX29 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trpc5Q9QX29 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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Trpc5Q9QX29 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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Trpc5Q9QX29 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trpc5Q9QX29 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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Trpc5Q9QX29 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trpc5Q9QX29 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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Trpc5Q9QX29 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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Trpc5Q9QX29 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trpc5Q9QX29 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trpc5Q9QX29 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trpc5Q9QX29 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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Trpc5Q9QX29 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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Trpc5Q9QX29 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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Trpc5Q9QX29 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trpc5Q9QX29 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trpc5Q9QX29 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trpc5Q9QX29 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trpc5Q9QX29 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trpc5Q9QX29 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trpc5Q9QX29 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trpc5Q9QX29 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trpc5Q9QX29 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trpc5Q9QX29 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trpc5Q9QX29 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trpc5Q9QX29 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trpc5Q9QX29 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trpc5Q9QX29 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Trpc5Q9QX29 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trpc5Q9QX29 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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