Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms