Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dkk3Q9QUN9 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms