Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG4

Nkain4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkain4Q9JMG4 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nkain4Q9JMG4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nkain4Q9JMG4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nkain4Q9JMG4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nkain4Q9JMG4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nkain4Q9JMG4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nkain4Q9JMG4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nkain4Q9JMG4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nkain4Q9JMG4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nkain4Q9JMG4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nkain4Q9JMG4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nkain4Q9JMG4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nkain4Q9JMG4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nkain4Q9JMG4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nkain4Q9JMG4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nkain4Q9JMG4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nkain4Q9JMG4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nkain4Q9JMG4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nkain4Q9JMG4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nkain4Q9JMG4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nkain4Q9JMG4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nkain4Q9JMG4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nkain4Q9JMG4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nkain4Q9JMG4 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nkain4Q9JMG4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nkain4Q9JMG4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nkain4Q9JMG4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nkain4Q9JMG4 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nkain4Q9JMG4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nkain4Q9JMG4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nkain4Q9JMG4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nkain4Q9JMG4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nkain4Q9JMG4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nkain4Q9JMG4 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nkain4Q9JMG4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nkain4Q9JMG4 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nkain4Q9JMG4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nkain4Q9JMG4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nkain4Q9JMG4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nkain4Q9JMG4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nkain4Q9JMG4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nkain4Q9JMG4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nkain4Q9JMG4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nkain4Q9JMG4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nkain4Q9JMG4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nkain4Q9JMG4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nkain4Q9JMG4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nkain4Q9JMG4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nkain4Q9JMG4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nkain4Q9JMG4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nkain4Q9JMG4 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nkain4Q9JMG4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nkain4Q9JMG4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nkain4Q9JMG4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nkain4Q9JMG4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nkain4Q9JMG4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nkain4Q9JMG4 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nkain4Q9JMG4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nkain4Q9JMG4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nkain4Q9JMG4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nkain4Q9JMG4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nkain4Q9JMG4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nkain4Q9JMG4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nkain4Q9JMG4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nkain4Q9JMG4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nkain4Q9JMG4 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nkain4Q9JMG4 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nkain4Q9JMG4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nkain4Q9JMG4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nkain4Q9JMG4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nkain4Q9JMG4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nkain4Q9JMG4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nkain4Q9JMG4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nkain4Q9JMG4 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nkain4Q9JMG4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nkain4Q9JMG4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nkain4Q9JMG4 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nkain4Q9JMG4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nkain4Q9JMG4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nkain4Q9JMG4 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nkain4Q9JMG4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nkain4Q9JMG4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nkain4Q9JMG4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nkain4Q9JMG4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nkain4Q9JMG4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nkain4Q9JMG4 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nkain4Q9JMG4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nkain4Q9JMG4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nkain4Q9JMG4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nkain4Q9JMG4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nkain4Q9JMG4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nkain4Q9JMG4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nkain4Q9JMG4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nkain4Q9JMG4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nkain4Q9JMG4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nkain4Q9JMG4 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nkain4Q9JMG4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nkain4Q9JMG4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nkain4Q9JMG4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nkain4Q9JMG4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms