Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMB0

Gkap1, G kinase-anchoring protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkap1Q9JMB0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gkap1Q9JMB0 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gkap1Q9JMB0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gkap1Q9JMB0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gkap1Q9JMB0 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gkap1Q9JMB0 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gkap1Q9JMB0 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gkap1Q9JMB0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gkap1Q9JMB0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms