Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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