Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Tgm1Q9JLF6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Tgm1Q9JLF6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Tgm1Q9JLF6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Tgm1Q9JLF6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
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Tgm1Q9JLF6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Tgm1Q9JLF6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Tgm1Q9JLF6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Tgm1Q9JLF6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Tgm1Q9JLF6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgm1Q9JLF6 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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