Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ldb3Q9JKS4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms