Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nova1Q9JKN6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms