Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Stx6Q9JKK1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms