Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Tuba8Q9JJZ2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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