Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY4

Ddx20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx20Q9JJY4 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ddx20Q9JJY4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ddx20Q9JJY4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ddx20Q9JJY4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ddx20Q9JJY4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ddx20Q9JJY4 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ddx20Q9JJY4 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ddx20Q9JJY4 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ddx20Q9JJY4 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ddx20Q9JJY4 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ddx20Q9JJY4 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ddx20Q9JJY4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ddx20Q9JJY4 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ddx20Q9JJY4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ddx20Q9JJY4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ddx20Q9JJY4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ddx20Q9JJY4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ddx20Q9JJY4 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ddx20Q9JJY4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ddx20Q9JJY4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ddx20Q9JJY4 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ddx20Q9JJY4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ddx20Q9JJY4 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ddx20Q9JJY4 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ddx20Q9JJY4 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ddx20Q9JJY4 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ddx20Q9JJY4 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ddx20Q9JJY4 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ddx20Q9JJY4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ddx20Q9JJY4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ddx20Q9JJY4 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ddx20Q9JJY4 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ddx20Q9JJY4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ddx20Q9JJY4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ddx20Q9JJY4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ddx20Q9JJY4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ddx20Q9JJY4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ddx20Q9JJY4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ddx20Q9JJY4 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ddx20Q9JJY4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ddx20Q9JJY4 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ddx20Q9JJY4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ddx20Q9JJY4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ddx20Q9JJY4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ddx20Q9JJY4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ddx20Q9JJY4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ddx20Q9JJY4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ddx20Q9JJY4 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ddx20Q9JJY4 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ddx20Q9JJY4 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ddx20Q9JJY4 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ddx20Q9JJY4 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ddx20Q9JJY4 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ddx20Q9JJY4 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ddx20Q9JJY4 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ddx20Q9JJY4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ddx20Q9JJY4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ddx20Q9JJY4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ddx20Q9JJY4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ddx20Q9JJY4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ddx20Q9JJY4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ddx20Q9JJY4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ddx20Q9JJY4 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ddx20Q9JJY4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ddx20Q9JJY4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ddx20Q9JJY4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ddx20Q9JJY4 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ddx20Q9JJY4 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ddx20Q9JJY4 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ddx20Q9JJY4 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ddx20Q9JJY4 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ddx20Q9JJY4 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ddx20Q9JJY4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ddx20Q9JJY4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ddx20Q9JJY4 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ddx20Q9JJY4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ddx20Q9JJY4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ddx20Q9JJY4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ddx20Q9JJY4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ddx20Q9JJY4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ddx20Q9JJY4 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ddx20Q9JJY4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ddx20Q9JJY4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ddx20Q9JJY4 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ddx20Q9JJY4 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ddx20Q9JJY4 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ddx20Q9JJY4 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ddx20Q9JJY4 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ddx20Q9JJY4 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ddx20Q9JJY4 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ddx20Q9JJY4 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ddx20Q9JJY4 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ddx20Q9JJY4 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ddx20Q9JJY4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ddx20Q9JJY4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ddx20Q9JJY4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ddx20Q9JJY4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ddx20Q9JJY4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ddx20Q9JJY4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ddx20Q9JJY4 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms