Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gfra4Q9JJT2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms