Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN6

Ctnnbip1, Beta-catenin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbip1Q9JJN6 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms