Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc86Q9JJ89 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms