Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS3

Smco4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco4Q9JIS3 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smco4Q9JIS3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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