Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI70

Mkks, McKusick-Kaufman/Bardet-Biedl syndromes putative chaperonin, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MkksQ9JI70 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MkksQ9JI70 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MkksQ9JI70 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MkksQ9JI70 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MkksQ9JI70 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MkksQ9JI70 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MkksQ9JI70 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MkksQ9JI70 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MkksQ9JI70 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MkksQ9JI70 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MkksQ9JI70 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MkksQ9JI70 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MkksQ9JI70 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MkksQ9JI70 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MkksQ9JI70 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MkksQ9JI70 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MkksQ9JI70 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MkksQ9JI70 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MkksQ9JI70 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MkksQ9JI70 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MkksQ9JI70 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MkksQ9JI70 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MkksQ9JI70 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MkksQ9JI70 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MkksQ9JI70 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MkksQ9JI70 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MkksQ9JI70 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MkksQ9JI70 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MkksQ9JI70 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MkksQ9JI70 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MkksQ9JI70 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MkksQ9JI70 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MkksQ9JI70 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MkksQ9JI70 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MkksQ9JI70 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MkksQ9JI70 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MkksQ9JI70 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MkksQ9JI70 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms