Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2ird1Q9JI57 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms