Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tcirg1Q9JHF5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms