Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cldn12Q9ET43 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn12Q9ET43 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn12Q9ET43 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn12Q9ET43 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn12Q9ET43 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn12Q9ET43 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn12Q9ET43 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn12Q9ET43 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn12Q9ET43 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn12Q9ET43 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn12Q9ET43 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn12Q9ET43 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn12Q9ET43 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn12Q9ET43 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn12Q9ET43 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn12Q9ET43 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn12Q9ET43 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn12Q9ET43 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn12Q9ET43 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn12Q9ET43 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn12Q9ET43 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn12Q9ET43 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn12Q9ET43 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn12Q9ET43 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn12Q9ET43 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn12Q9ET43 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn12Q9ET43 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn12Q9ET43 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn12Q9ET43 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn12Q9ET43 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn12Q9ET43 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn12Q9ET43 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn12Q9ET43 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn12Q9ET43 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn12Q9ET43 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn12Q9ET43 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn12Q9ET43 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn12Q9ET43 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn12Q9ET43 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn12Q9ET43 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn12Q9ET43 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn12Q9ET43 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn12Q9ET43 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn12Q9ET43 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn12Q9ET43 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn12Q9ET43 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn12Q9ET43 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn12Q9ET43 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn12Q9ET43 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn12Q9ET43 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn12Q9ET43 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn12Q9ET43 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn12Q9ET43 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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