Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Trim39Q9ESN2 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Trim39Q9ESN2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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