Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OtofQ9ESF1 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16■□□□□ 0.15
OtofQ9ESF1 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms