Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES81

Popdc3, Popeye domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Popdc3Q9ES81 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Popdc3Q9ES81 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Popdc3Q9ES81 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Popdc3Q9ES81 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Popdc3Q9ES81 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Popdc3Q9ES81 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Popdc3Q9ES81 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Popdc3Q9ES81 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Popdc3Q9ES81 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Popdc3Q9ES81 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Popdc3Q9ES81 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Popdc3Q9ES81 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Popdc3Q9ES81 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Popdc3Q9ES81 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Popdc3Q9ES81 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Popdc3Q9ES81 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Popdc3Q9ES81 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Popdc3Q9ES81 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Popdc3Q9ES81 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Popdc3Q9ES81 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Popdc3Q9ES81 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Popdc3Q9ES81 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Popdc3Q9ES81 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Popdc3Q9ES81 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Popdc3Q9ES81 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Popdc3Q9ES81 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Popdc3Q9ES81 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Popdc3Q9ES81 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Popdc3Q9ES81 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Popdc3Q9ES81 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Popdc3Q9ES81 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Popdc3Q9ES81 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Popdc3Q9ES81 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Popdc3Q9ES81 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Popdc3Q9ES81 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Popdc3Q9ES81 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Popdc3Q9ES81 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Popdc3Q9ES81 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Popdc3Q9ES81 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Popdc3Q9ES81 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Popdc3Q9ES81 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Popdc3Q9ES81 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Popdc3Q9ES81 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Popdc3Q9ES81 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Popdc3Q9ES81 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Popdc3Q9ES81 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Popdc3Q9ES81 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Popdc3Q9ES81 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Popdc3Q9ES81 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Popdc3Q9ES81 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Popdc3Q9ES81 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Popdc3Q9ES81 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Popdc3Q9ES81 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Popdc3Q9ES81 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Popdc3Q9ES81 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Popdc3Q9ES81 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Popdc3Q9ES81 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Popdc3Q9ES81 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Popdc3Q9ES81 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Popdc3Q9ES81 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Popdc3Q9ES81 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Popdc3Q9ES81 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Popdc3Q9ES81 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Popdc3Q9ES81 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Popdc3Q9ES81 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Popdc3Q9ES81 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Popdc3Q9ES81 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Popdc3Q9ES81 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Popdc3Q9ES81 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Popdc3Q9ES81 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Popdc3Q9ES81 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Popdc3Q9ES81 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Popdc3Q9ES81 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Popdc3Q9ES81 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Popdc3Q9ES81 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Popdc3Q9ES81 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Popdc3Q9ES81 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Popdc3Q9ES81 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Popdc3Q9ES81 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Popdc3Q9ES81 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Popdc3Q9ES81 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Popdc3Q9ES81 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Popdc3Q9ES81 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Popdc3Q9ES81 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Popdc3Q9ES81 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Popdc3Q9ES81 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Popdc3Q9ES81 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Popdc3Q9ES81 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Popdc3Q9ES81 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Popdc3Q9ES81 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Popdc3Q9ES81 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Popdc3Q9ES81 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Popdc3Q9ES81 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Popdc3Q9ES81 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Popdc3Q9ES81 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Popdc3Q9ES81 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Popdc3Q9ES81 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Popdc3Q9ES81 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Popdc3Q9ES81 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Popdc3Q9ES81 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.2 ms