Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERG0

Lima1, LIM domain and actin-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lima1Q9ERG0 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Lima1Q9ERG0 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lima1Q9ERG0 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms