Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER80

Rtp4, Receptor-transporting protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp4Q9ER80 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtp4Q9ER80 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtp4Q9ER80 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtp4Q9ER80 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtp4Q9ER80 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtp4Q9ER80 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtp4Q9ER80 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtp4Q9ER80 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtp4Q9ER80 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtp4Q9ER80 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtp4Q9ER80 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtp4Q9ER80 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtp4Q9ER80 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtp4Q9ER80 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rtp4Q9ER80 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rtp4Q9ER80 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rtp4Q9ER80 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rtp4Q9ER80 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rtp4Q9ER80 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rtp4Q9ER80 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rtp4Q9ER80 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtp4Q9ER80 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtp4Q9ER80 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtp4Q9ER80 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtp4Q9ER80 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtp4Q9ER80 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtp4Q9ER80 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtp4Q9ER80 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtp4Q9ER80 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtp4Q9ER80 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtp4Q9ER80 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtp4Q9ER80 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtp4Q9ER80 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtp4Q9ER80 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtp4Q9ER80 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtp4Q9ER80 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtp4Q9ER80 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtp4Q9ER80 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtp4Q9ER80 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtp4Q9ER80 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtp4Q9ER80 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtp4Q9ER80 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtp4Q9ER80 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtp4Q9ER80 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtp4Q9ER80 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtp4Q9ER80 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtp4Q9ER80 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtp4Q9ER80 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtp4Q9ER80 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtp4Q9ER80 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtp4Q9ER80 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtp4Q9ER80 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtp4Q9ER80 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtp4Q9ER80 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtp4Q9ER80 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtp4Q9ER80 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtp4Q9ER80 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtp4Q9ER80 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtp4Q9ER80 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtp4Q9ER80 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtp4Q9ER80 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtp4Q9ER80 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtp4Q9ER80 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtp4Q9ER80 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtp4Q9ER80 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtp4Q9ER80 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtp4Q9ER80 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtp4Q9ER80 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtp4Q9ER80 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtp4Q9ER80 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtp4Q9ER80 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtp4Q9ER80 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtp4Q9ER80 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtp4Q9ER80 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtp4Q9ER80 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtp4Q9ER80 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtp4Q9ER80 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtp4Q9ER80 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtp4Q9ER80 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtp4Q9ER80 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtp4Q9ER80 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtp4Q9ER80 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtp4Q9ER80 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtp4Q9ER80 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtp4Q9ER80 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtp4Q9ER80 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtp4Q9ER80 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtp4Q9ER80 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtp4Q9ER80 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtp4Q9ER80 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtp4Q9ER80 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtp4Q9ER80 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtp4Q9ER80 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtp4Q9ER80 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtp4Q9ER80 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtp4Q9ER80 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtp4Q9ER80 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtp4Q9ER80 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtp4Q9ER80 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtp4Q9ER80 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms