Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER60

Scn4a, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4aQ9ER60 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Scn4aQ9ER60 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scn4aQ9ER60 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scn4aQ9ER60 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scn4aQ9ER60 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Scn4aQ9ER60 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scn4aQ9ER60 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scn4aQ9ER60 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Scn4aQ9ER60 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scn4aQ9ER60 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scn4aQ9ER60 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Scn4aQ9ER60 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Scn4aQ9ER60 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Scn4aQ9ER60 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scn4aQ9ER60 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scn4aQ9ER60 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scn4aQ9ER60 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scn4aQ9ER60 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scn4aQ9ER60 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scn4aQ9ER60 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scn4aQ9ER60 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scn4aQ9ER60 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scn4aQ9ER60 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scn4aQ9ER60 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scn4aQ9ER60 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scn4aQ9ER60 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Scn4aQ9ER60 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scn4aQ9ER60 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scn4aQ9ER60 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scn4aQ9ER60 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scn4aQ9ER60 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scn4aQ9ER60 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scn4aQ9ER60 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scn4aQ9ER60 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scn4aQ9ER60 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scn4aQ9ER60 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scn4aQ9ER60 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scn4aQ9ER60 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Scn4aQ9ER60 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scn4aQ9ER60 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scn4aQ9ER60 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scn4aQ9ER60 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scn4aQ9ER60 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scn4aQ9ER60 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scn4aQ9ER60 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Scn4aQ9ER60 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Scn4aQ9ER60 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Scn4aQ9ER60 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms