Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQR4

Clca3a2, Chloride channel accessory 3A2, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a2Q9EQR4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca3a2Q9EQR4 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms