Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH7

Ndst3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst3Q9EQH7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndst3Q9EQH7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndst3Q9EQH7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndst3Q9EQH7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndst3Q9EQH7 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndst3Q9EQH7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndst3Q9EQH7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndst3Q9EQH7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndst3Q9EQH7 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndst3Q9EQH7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndst3Q9EQH7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndst3Q9EQH7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndst3Q9EQH7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndst3Q9EQH7 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndst3Q9EQH7 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndst3Q9EQH7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndst3Q9EQH7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndst3Q9EQH7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndst3Q9EQH7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndst3Q9EQH7 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndst3Q9EQH7 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndst3Q9EQH7 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndst3Q9EQH7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndst3Q9EQH7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndst3Q9EQH7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndst3Q9EQH7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndst3Q9EQH7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndst3Q9EQH7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndst3Q9EQH7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndst3Q9EQH7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndst3Q9EQH7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndst3Q9EQH7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndst3Q9EQH7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndst3Q9EQH7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndst3Q9EQH7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndst3Q9EQH7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndst3Q9EQH7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndst3Q9EQH7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndst3Q9EQH7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndst3Q9EQH7 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndst3Q9EQH7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndst3Q9EQH7 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndst3Q9EQH7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndst3Q9EQH7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndst3Q9EQH7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndst3Q9EQH7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndst3Q9EQH7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndst3Q9EQH7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndst3Q9EQH7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndst3Q9EQH7 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndst3Q9EQH7 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndst3Q9EQH7 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndst3Q9EQH7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndst3Q9EQH7 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndst3Q9EQH7 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndst3Q9EQH7 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndst3Q9EQH7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndst3Q9EQH7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndst3Q9EQH7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndst3Q9EQH7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndst3Q9EQH7 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndst3Q9EQH7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndst3Q9EQH7 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndst3Q9EQH7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndst3Q9EQH7 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndst3Q9EQH7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndst3Q9EQH7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndst3Q9EQH7 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndst3Q9EQH7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndst3Q9EQH7 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndst3Q9EQH7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndst3Q9EQH7 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndst3Q9EQH7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndst3Q9EQH7 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ndst3Q9EQH7 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ndst3Q9EQH7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ndst3Q9EQH7 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ndst3Q9EQH7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ndst3Q9EQH7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndst3Q9EQH7 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndst3Q9EQH7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndst3Q9EQH7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndst3Q9EQH7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndst3Q9EQH7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndst3Q9EQH7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndst3Q9EQH7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndst3Q9EQH7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndst3Q9EQH7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndst3Q9EQH7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndst3Q9EQH7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndst3Q9EQH7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndst3Q9EQH7 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndst3Q9EQH7 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndst3Q9EQH7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndst3Q9EQH7 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndst3Q9EQH7 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndst3Q9EQH7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndst3Q9EQH7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndst3Q9EQH7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndst3Q9EQH7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms