Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rpgrip1Q9EPQ2 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rpgrip1Q9EPQ2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms