Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCQ7

Serpina1f, Alpha-1-antitrypsin 1-6, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1fQ9DCQ7 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Serpina1fQ9DCQ7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Serpina1fQ9DCQ7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Serpina1fQ9DCQ7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Serpina1fQ9DCQ7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Serpina1fQ9DCQ7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Serpina1fQ9DCQ7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Serpina1fQ9DCQ7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Serpina1fQ9DCQ7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Serpina1fQ9DCQ7 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Serpina1fQ9DCQ7 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Serpina1fQ9DCQ7 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Serpina1fQ9DCQ7 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Serpina1fQ9DCQ7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Serpina1fQ9DCQ7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Serpina1fQ9DCQ7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Serpina1fQ9DCQ7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Serpina1fQ9DCQ7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Serpina1fQ9DCQ7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Serpina1fQ9DCQ7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Serpina1fQ9DCQ7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Serpina1fQ9DCQ7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Serpina1fQ9DCQ7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Serpina1fQ9DCQ7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Serpina1fQ9DCQ7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Serpina1fQ9DCQ7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Serpina1fQ9DCQ7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Serpina1fQ9DCQ7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Serpina1fQ9DCQ7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Serpina1fQ9DCQ7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Serpina1fQ9DCQ7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Serpina1fQ9DCQ7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Serpina1fQ9DCQ7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Serpina1fQ9DCQ7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Serpina1fQ9DCQ7 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Serpina1fQ9DCQ7 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Serpina1fQ9DCQ7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Serpina1fQ9DCQ7 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Serpina1fQ9DCQ7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Serpina1fQ9DCQ7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Serpina1fQ9DCQ7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Serpina1fQ9DCQ7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Serpina1fQ9DCQ7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Serpina1fQ9DCQ7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Serpina1fQ9DCQ7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Serpina1fQ9DCQ7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Serpina1fQ9DCQ7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Serpina1fQ9DCQ7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Serpina1fQ9DCQ7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Serpina1fQ9DCQ7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Serpina1fQ9DCQ7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Serpina1fQ9DCQ7 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Serpina1fQ9DCQ7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Serpina1fQ9DCQ7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Serpina1fQ9DCQ7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Serpina1fQ9DCQ7 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Serpina1fQ9DCQ7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Serpina1fQ9DCQ7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Serpina1fQ9DCQ7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Serpina1fQ9DCQ7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Serpina1fQ9DCQ7 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Serpina1fQ9DCQ7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Serpina1fQ9DCQ7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Serpina1fQ9DCQ7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Serpina1fQ9DCQ7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Serpina1fQ9DCQ7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Serpina1fQ9DCQ7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Serpina1fQ9DCQ7 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Serpina1fQ9DCQ7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Serpina1fQ9DCQ7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Serpina1fQ9DCQ7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Serpina1fQ9DCQ7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Serpina1fQ9DCQ7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Serpina1fQ9DCQ7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Serpina1fQ9DCQ7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Serpina1fQ9DCQ7 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Serpina1fQ9DCQ7 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Serpina1fQ9DCQ7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Serpina1fQ9DCQ7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Serpina1fQ9DCQ7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Serpina1fQ9DCQ7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Serpina1fQ9DCQ7 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Serpina1fQ9DCQ7 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Serpina1fQ9DCQ7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Serpina1fQ9DCQ7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Serpina1fQ9DCQ7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Serpina1fQ9DCQ7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Serpina1fQ9DCQ7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Serpina1fQ9DCQ7 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Serpina1fQ9DCQ7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Serpina1fQ9DCQ7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Serpina1fQ9DCQ7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Serpina1fQ9DCQ7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Serpina1fQ9DCQ7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Serpina1fQ9DCQ7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Serpina1fQ9DCQ7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Serpina1fQ9DCQ7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Serpina1fQ9DCQ7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Serpina1fQ9DCQ7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Serpina1fQ9DCQ7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms