Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnft1Q9DCN7 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnft1Q9DCN7 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnft1Q9DCN7 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnft1Q9DCN7 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnft1Q9DCN7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnft1Q9DCN7 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnft1Q9DCN7 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnft1Q9DCN7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnft1Q9DCN7 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnft1Q9DCN7 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnft1Q9DCN7 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnft1Q9DCN7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnft1Q9DCN7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnft1Q9DCN7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnft1Q9DCN7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnft1Q9DCN7 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnft1Q9DCN7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnft1Q9DCN7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnft1Q9DCN7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnft1Q9DCN7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnft1Q9DCN7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnft1Q9DCN7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnft1Q9DCN7 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnft1Q9DCN7 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnft1Q9DCN7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnft1Q9DCN7 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnft1Q9DCN7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnft1Q9DCN7 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnft1Q9DCN7 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnft1Q9DCN7 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnft1Q9DCN7 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnft1Q9DCN7 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnft1Q9DCN7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnft1Q9DCN7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnft1Q9DCN7 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnft1Q9DCN7 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms